日本ジェネティクスのテクニカルノートとは?
発売したばかりの新製品の性能評価や、既存製品の最適な条件を追求するための条件検討をすることでお客様に心からご納得頂いた上で商品をお使い頂けるよう、様々な評価試験を行っています。
採用前の検討資料として、または採用後の最適条件検討資料としてご活用ください。
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評価製品:Taq Pro Universal SYBR qPCR Master Mix(Vazyme Biotech Co., Ltd. / Cat.No. Q712-02)
背景
Vazyme Biotech社 Taq Pro Universal SYBR qPCR Master Mixは、ROXがプレミックスされており、ROX補正が必要な様々なリアルタイムPCR装置はもちろん、ROX補正の必要のない装置でも使用できるSYBR試薬である。
また、一般的に使用されるSYBR試薬より蛍光強度が高く、S/N比を使用して補正を行う装置では、きれいなデータが得られる利点もある。
本資料では、研究室で多く使用されている一般的なSYBR試薬とTaq Pro Universal SYBR qPCR Master Mixが、同等の性能であるか比較検証を行った。
実験条件
- 評価試薬
Taq Pro Universal SYBR qPCR Master Mix(Vazyme Biotech Co., Ltd. / Cat.No. Q712-02)
TY社 SYBR qPCR Mix - 使用装置
LightCycler® 96 System(ロシュ・ダイアグノスティックス株式会社 / Cat.No. 05815916001, 以下LC96)
QuantStudio 5(Thermo Fisher SCIENTIFIC, 以下QS5) - サンプル
Human Genomic DNA; Male(Promega / Cat.No. G1471)
5 ng/μL, 1 ng/μL, 0.2 ng/μL, 0 ng/μL(Negative Control)に希釈を行い、使用した。 - Primer
human beta-actin / amplicon 295 bp
Forward : TCACCCACACTGTGCCCATCTACGA
Reverse : CAGCGGAACCGCTCATTGCCAATGG
human insulin / amplicon 132 bp
Forward : AGAGGGGTGGTGAGTCTGTG
Reverse : GCCAAAACAGGCTACTTTGCT - 反応組成
LightCycler 96
QuantStudio 5
* QuantStudio 5は、ROX補正が必要な機器のため、TY社試薬付属 50x ROX reference dyeを使用した。 - 反応プログラム
LightCycler 96
QuantStudio 5
結果
RAWデータ
ーhuman beta-actin ーhuman insulin
RAWデータでは、蛍光強度の上限がTY社SYBR qPCR Mix より、Taq Pro Universal SYBR qPCR Master Mix の方がかなり高い数値となった。
Analysisデータ
ーhuman beta-actin ーhuman insulin
TY社SYBR qPCR Mix、Taq Pro Universal SYBR qPCR Master Mixともにきれいな波形が認められた。
Cq値
LC96 | QS5 | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
human beta-actin | human insulin | human beta-actin | human insulin | |||||
Vazyme | TY社 | Vazyme | TY社 | Vazyme | TY社 | Vazyme | TY社 | |
5 ng/μL | 21.36 | 21.04 | 23.64 | 23.15 | 22.54 | 21.38 | 25.04 | 23.42 |
5 ng/μL | 21.31 | 21.06 | 23.64 | 23.19 | 22.65 | 21.19 | 24.98 | 23.36 |
1 ng/μL | 23.48 | 22.77 | 25.57 | 25.03 | 25.06 | 23.46 | 27.41 | 25.35 |
1 ng/μL | 23.46 | 22.83 | 25.43 | 24.84 | 25.11 | 23.55 | 27.26 | 25.56 |
0.2 ng/μL | 25.89 | 25.95 | 27.85 | 27.99 | 27.69 | 26.18 | 29.96 | 28.04 |
0.2 ng/μL | 25.99 | 25.65 | 28.09 | 27.68 | 27.71 | 26.28 | 29.74 | 27.76 |
NC | 36.73 | 41.28 | – | – | – | – | – | – |
NC | – | 40.32 | – | – | – | – | – | – |
VazymeとTY社を比較し、Cq値に大きな差は認められなかった
これより、 Vazyme Biotech社 Taq Pro Universal SYBR qPCR Master MixとTY社SYBR qPCR Mixは、同等であると考えられる。