完全長RNAシーケンスによって、スプライシングバリアントの真の姿に迫る！
この度、弊社のNGS受託解析サービスにNovogene社の「完全長RNAシーケンス」が新たに加わりました。
これまで、技術的な限界から見逃されてきたスプライシングバリアント。しかし、ロングリードシーケンス技術の進化により、その全貌が解き明かされつつあります。スプライシング解析の新たなスタンダードとして今注目の「完全長RNAシーケンス」を皆さまの研究にぜひご活用ください。
サービス概要
これまでのショートリードRNAシーケンスでは、一つの遺伝子から発現するスプライシングバリアント（mRNAのアイソフォームの多様性）の詳細を研究することは困難でした。しかし近年、スプライシングバリアントのダイナミクスが多くの生命現象に関わることが指摘されており、しかもその大部分がまだ未発見だと言われています。そこで、これを解決できるロングリードシーケンスによる完全長RNAシーケンスが注目されています。最近の報告によれば、完全長RNAシーケンスによって得られた20万リードのうち、実に40％ものアイソフォームが新規であったという報告もなされています（Reese et al. 2024）。このことから、これからは完全長RNAシーケンスによって新しいアイソフォームが次々と発見され、新たな生命現象や病態の解明に寄与していくことが期待されます。
PacBioはこの完全長RNAシーケンスをハイスループットかつ低コストで解析できるKinnex full-length RNA-Seqを開発しました。
Novogeneはこれをいち早く導入し、研究者の皆様にリーズナブルに提供します。
※Novogene社は国内で最初のPacBio Kinnex解析プロバイダーです。
サービス仕様
- シーケンサー：PacBio Revio
- 納品データ：BAMファイル形式
- 納品方法：データダウンロード（100 Gb未満）/HDD納品（100 Gb以上）
- ライブラリー調製方法：Kinnex full-length RNA kit
- サンプル要件
・サンプルタイプ：Total RNA
・サンプル量：≥ 1.2 μg
・濃度：≥ 40 ng/μL
・RIN(Agilent 2100)：≥ 6.5 with the smooth baseline
・純度：A260/280:1.8-2.0 A260/230:1.3-2.5
- データ解析：Pacbio Kinnexデータ解析
- 納期：
・解析なし⇒サンプルQC合格後30営業日
・解析あり⇒サンプルQC合格後45営業日
| Cat.No. | メニュー | 単位 | 価格（税抜） |
|---|---|---|---|
| NV-KINNEX5M | 完全長 RNAシーケンス 5M HiFiリード | 一式 | お問い合わせ |
| NV-KINNEX10M | 完全長 RNAシーケンス 10M HiFiリード | 一式 | お問い合わせ |
※価格は2025年4月現在のものです。
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