【新発売】NGSライブラリー用ターゲットエンリッチメントキット「KAPA HyperPETE」で使用するパネルと試薬キット

KAPA-HyperPETE アイキャッチ

用途に応じたキャプチャーパネルが選択可能

特定領域のキャプチャーにプライマーの伸長反応を応用した画期的なヒト由来NGSライブラリー用ターゲットエンリッチメントキット、KAPA HyperPETEで使用する3つの製品が新発売!
すぐに利用できる固定デザインパネル「カタログパネル」と、自身の研究テーマの沿って自由に設定できる「カスタムパネル」、それらのパネルと組み合わせて使用する「Reagent Kit」の3製品です。

この記事でご紹介した製品

KAPA HyperPETEとは

KAPA HyperPETEは、フォーカスしている少数の遺伝子(DNA: 250 Kbまで、RNA: 50 Kbまで)の低頻度変異のために特に最適化された、ヒト由来NGSライブラリーを対象としたターゲットエンリッチメントキットです。
SNVs、インデル、CNVs、MSI、RNA Fusionなど、多様な遺伝子多型の検出で使用が検証されており、優れたパフォーマンスと簡便なワークフローが、効率的なキャプチャーシーケンスを可能にします。
cfDNA、FFPE、RNA、Germline、各スターティングマテリアルに応じたプロトコルが準備されています。

KAPA HyperPETE カタログパネル

KAPA HyperPETE カタログパネルの製品特長

KAPA HyperPETE カタログパネル
  • 疾患関与の遺伝子を的確にキャプチャーするためにデザインされたKAPA HyperPETE用キャプチャープライマー&リリースプライマーセットです。
  • 目的に応じた5つの固定デザインパネル

製品価格

CatNo. 製品名 単位 価格(税抜き)
09329161001 KAPA HyperPETE Pan Cancer Panel, 24 rxn 24反応 ¥400,000
09329234001 KAPA HyperPETE HotSpot Panel, 24 rxn 24反応 ¥135,000
09329315001 KAPA HyperPETE Hereditary Oncology Panel, 24 rxn 24反応 ¥270,000
09329382001 KAPA HyperPETE Newborn Screening Panel, 24 rxn 24反応 ¥270,000
09329471001 KAPA HyperPETE LC Fusion Panel, 24 rxn 24反応 ¥380,000 

※入数違いも取り扱いがございます。詳しくはこちらをご覧ください。
※価格は2022年9月現在のものです。

KAPA HyperPETE カタログパネルの詳細・価格はこちら

KAPA HyperPETE Pan Cancer Panel

KAPA HyperPETE Pan Cancer Panelは86個のヒトがん関連遺伝子と190のMSI遺伝子座をカバーしている(ターゲットサイズ302 Kb)、汎がんの体細胞変異解析に用いるカタログパネルです。

ターゲット遺伝子リスト

ABL1, AKT1, ALK, APC, ARID1A, ATM, ATR, BRAF, BRCA1, BRCA2, BRIP1, CDH1, CDK4,  CDKN2A, CSF1R, CTNNB1, DDR2, DNMT3A, EGFR, ERBB2, ERBB3, ERCC2, ERCC3,  ERCC4, ESR1, EZH2, FANCA, FBXW7, FGFR1, FGFR2, FGFR3, FLT3, GNA11, GNAQ,  GNAS, HNF1A, HRAS, IDH1, IDH2, JAK1, JAK2, JAK3, KIT, KRAS, MAP2K1, MAP2K2,  MET, MLH1, MPL, MSH2, MSH6, MTOR, NF1, NF2, NFE2L2, NOTCH1, NPM1, NRAS,  NTRK1, NTRK2, NTRK3, PDGFRA, PIK3CA, PMS2, POLE, PTCH1, PTEN, PTPN11, RAD50,  RAD51C, RAD51D, RAF1, RB1, RET, ROS1, SETD2, SMAD4, SMARCB1, SMO, SRC,  STK11, TERT, TP53, TSC1, TSC2, VHL 及び、190のMSI遺伝子座

KAPA HyperPETE HotSpot Panel

KAPA HyperPETE Hot Spot Panelはヒトがん遺伝子上の変異「ホットスポット」領域を解析するためのカタログパネルで、37個の遺伝子の40 Kbをターゲットとしています。

ターゲット遺伝子リスト

AKT1, ALK, APC, ATM, BRAF, BRCA1, CDKN2A, CTNNB1, EGFR, ERBB2, ESR1, FBXW7,  FGFR1, FGFR2, FGFR3, GNA11, GNAQ, GNAS, HRAS, IDH1, IDH2, JAK2, KIT, KRAS, NF1,  NRAS, NTRK3, PDGFRA, PIK3CA, POLE, PTCH1, PTEN, RET, STK11, TP53, TSC1, TSC2

KAPA HyperPETE Hereditary Oncology Panel

KAPA HyperPETE Hereditary Oncology Panelは遺伝性乳がん及び卵巣がんや、遺伝性大腸がんなどの遺伝性腫瘍にフォーカスしたカタログパネルで、生殖細胞変異の解析に使用します。BRCA1、BRCA2を含む、47個の遺伝性腫瘍に関連した遺伝子をカバーしています(ターゲットサイズ200 Kb)。

ターゲット遺伝子リスト

APC, ATM, AXIN2, BARD1, BMPR1A, BRCA1, BRCA2, BRIP1, CDH1, CDK4, CDKN2A, CHEK2, CTNNA1, DICER1, EPCAM, GREM1, HOXB13, KIT, MEN1, MLH1, MSH2, MSH3, MSH6, MUTYH, NBN, NF1, NTHL1, PALB2, PDGFRA, PMS2, POLD1, POLE, PTEN, RAD50, RAD51C, RAD51D, SDHA, SDHB, SDHC, SDHD, SMAD4, SMARCA4, STK11, TP53, TSC1, TSC2, VHL

KAPA HyperPETE Newborn Screening Panel

KAPA HyperPETE Newborn Screening Panelは、89個の疾患遺伝子の生殖細胞変異を調べる際に使用するカタログパネルです(ターゲットサイズ290 Kb)。

ターゲット遺伝子リスト

ABCD1, ACADM, ACADVL, ACAT1, ADA, AK2, ASL, ASS1, ATM, BCKDHA, BCKDHB, BLNK, BTD, BTK, CBS, CD247, CD3D, CD3E, CD3G, CD40LG, CFTR, CHD7, CORO1A, CYP11A1, CYP11B1, CYP17A1, CYP21A2, DBT, DCLRE1C, DKC1, DOCK2, DOCK8, FAH, FOXN1, GAA, GALE, GALK1, GALT, GATA2, GCDH, HADHA, HADHB, HBB, HLCS, HMGCL, HSD3B2, IDUA, IGHM, IL2RG, IL7R, IVD, JAK3, LIG4, MCCC1, MCCC2, MCEE, MMAA, MMAB, MMADHC, MMUT, MTHFD1, MTHFR, MTR, MTRR, NBN, NHEJ1, ORAI1, PAH, PAX8, PCCA, PCCB, PNP, POR, PRKDC, PTPRC, RAC2, RAG1, RAG2, RMRP, SLC22A5, SLC46A1, SMN1, STAR, STAT5B, STIM1, TBX1, TSHR, WAS, ZAP70

KAPA HyperPETE LC (Lung Cancer) Fusion Panel

KAPA HyperPETE LC Fusion Panel は融合遺伝子解析のためのカタログパネルで、既知または新規の融合パートナーを検出するためにRNAから解析を行います。肺がんで多く検出される17個の融合遺伝子をターゲットにした18 Kbのパネルで、内部コントロールの4つのハウスキーピング遺伝子もカバーされています。

ターゲット遺伝子リスト

ALK, AXL, BRAF, EGFR, FGFR1, FGFR2, FGFR3, MET, NRG1, NTRK1, NTRK2, NTRK3,  PDGFRA, PDGFRB, PPARG, RET, ROS1
Housekeeping Genes: RAB7A, VCP, CHMP2A, HPRT1

 

KAPA HyperPETE カスタムパネル

KAPA HyperPETE カスタムパネルの製品特長

自由に設定したヒトターゲット遺伝子(領域)に対する最適化済みKAPA HyperPETE用キャプチャープライマー&リリースプライマーのセットです。

  • KAPA HyperPETE Choice:HyperDesignツールで設計するカスタムパネル
  • KAPA HyperPETE Explore:HyperDesignツール経由で依頼するRoche社デザイナーが設計するカスタムパネル

製品価格

CatNo. 概要 単位 価格(税抜き)
KAPA HyperPETE Choice
09418741001 KAPA HyperPETE Choice 75 Kb-96 rxn 96反応 ¥1,140,000
09418806001 KAPA HyperPETE Choice 150 Kb-96 rxn 96反応 ¥2,900,000
09418873001 KAPA HyperPETE Choice 250 Kb-96 rxn 96反応 ¥3,550,000
09418938001 KAPA HyperPETE Choice RNA 50 Kb-96 rxn 96反応 ¥1,140,000
KAPA HyperPETE Explore
09419004001 KAPA HyperPETE Explore 75 Kb-96 rxn 96反応 ¥1,140,000
09419071001 KAPA HyperPETE Explore 150 Kb-96 rxn 96反応 ¥2,900,000
09419136001 KAPA HyperPETE Explore 250 Kb-96 rxn 96反応 ¥3,550,000
09419209001 KAPA HyperPETE Explore RNA 50 Kb-96 rxn 96反応 ¥1,140,000

※入数違いも取り扱いがございます。詳しくはこちらをご覧ください。
※価格は2022年9月現在のものです。

KAPA HyperPETE カスタムパネルの詳細・価格はこちら

HyperDesign ツール(プローブデザインツール)

カスタムデザインには、KAPA HyperCapture(KAPA HyperChoice Kit, KAPA HyperExplore Kit) のデザインにも使用される、オンラインツール『Hyper Design』で行います。直感的で使いやすいインターフェースとロシュ社独自のアルゴリズムにより、少ないリード数でより深く均一なカバレッジを実現するためのデザインが、プローブデザインが初めての方や専門の知識をお持ちでない方でも容易に得ることができます。また、購入前にデザインをレビューできるので安心してご使用いただけます。

HyperDesign ツール

 

KAPA HyperPETE Reagent Kit

KAPA HyperPETE Reagent Kitの製品特長

KAPA HyperPETE Reagent Kit
  • PETE反応に必要な濃縮、洗浄、その後の PCR 用の試薬が含まれており、KAPA HyperPETE パネル(キャプチャープライマー&リリースプライマー)と組み合わせて使用することで、KAPA HyperPETEワークフローを実施することができます。
  • ライブラリー調製試薬やアダプターなどが別途必要となります。

製品価格

CatNo. 概要 単位 価格(税抜き)
09211624001 KAPA HyperPETE Reagent Kit, 24 rxn 24反応 ¥213,000
09211683001 KAPA HyperPETE Reagent Kit, 96 rxn 96反応 ¥398,000

※価格は2022年9月現在のものです。

KAPA HyperPETE Reagent Kitの詳細・価格はこちら

この記事でご紹介した製品

より詳しい資料・取扱説明書などは下記リンクより製品詳細ページをご覧ください。

KAPA HyperPETE カタログパネル

KAPA HyperPETE カスタムパネル

KAPA HyperPETE Reagent Kit

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