優れたプローブデザイン技術と、最新のデータベースを使用

主要なゲノムデータベースを参照することで、より多くの領域をカバーし、高品質なシーケンス結果を実現可能とする、KAPA HyperExome V2 kitが新たに発売されました。高性能な本製品について、詳しく解説します。

この記事でご紹介した製品

高性能エクソームデザインパネル

KAPA HyperExome V2 kitについて

長年培われ蓄積されたオリジナルのプローブデザインアルゴリズムと、最新のハイブリッドキャプチャーテクノロジーが組み合わされたKAPA HyperExome V2 kitは、さまざまなメリットを提供します。

製品特長

• ターゲット：デザイン済ヒト全エクソームパネル
• ターゲットサイズ：43.2 Mb
• カバー遺伝子数：20,626
• データベース：ClinVar(June 29, 2022)、COSMIC、ACMGv3.1、Ensembl(release v106)、RefSeq(June 29, 2022)、CCDS、GENCODE、HGMD
  ※GRCh38ゲノムアセンブリでは明らかになっていなかった領域を特定するため、設計プロセスの一部としてT2T (telomere-to-telomere) ゲノムアセンブリーが利用されています。
• プレキャプチャープレックス：最大16 プレックス／反応

「読めない領域」を限りなくゼロに

最適なシーケンスカバレッジ

優れたエクソームプローブのデザインにより、最適なシーケンスカバレッジを得る事が可能です。
主要なゲノムデータベースを参照する事で、より多くの領域をカバーし、高品質なシーケンス結果を実現します。

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カバレッジデータのポイント！
主要なゲノムデータベースにおいて、他社のデザインプローブと比較したところ、 KAPA HyperExome V2はより多くの領域がカバーされ、プローブのデザインが優れている事がわかります。（最大で17%向上）

他社エクソームプローブとのカバレッジ比較

最新のデータベースに基づいてプローブが設計されているため、他社製品ではカバーできない困難領域もカバーされています。

TSFM領域におけるKAPA HyperExomeV2と他社Exome製品のプローブデザイン

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プローブデザイン比較のポイント！
A社、C社のExome製品はTSFM遺伝子のExon5がデザインされていませんが、KAPA HyperExome V2では、デザインされていることがわかります。
リピート領域はプローブのデザインが難しいとされており、他社製品ではデザインができなかったと思われます。

実際にシーケンスを行った結果（TSFM領域）

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カバレッジデプス比較のポイント！
プローブがデザインされていないものはもちろんカバーされませんが、B社のExome製品ではプローブは設計されているものの、シーケンスではカバーされていません。この図から、TSFM領域のExon5においては、KAPA HyperExome V2のみカバーされている事がわかります。
KAPA HyperExome V2プローブでは、ロットごとにNGSでのQCを実施し、プローブの品質をチェックしているため、デザインされた領域において高品質なシーケンスデータを得る事が可能です。

カバレッジ比較データの見るべきポイントや製品に関する詳細は、弊社テクニカルスタッフが詳しく解説することも可能です！ぜひ下記フォームより、お気軽にお問い合わせください。

イタリア・ヴェローナ大学の教授が解説！

ウェビナー動画の紹介

~The latest whole-exome sequencing solution shows high performance in the real-world setting~
～現実世界で高いパフォーマンスを発揮する最新の全エクソームシーケンスソリューション～

Roche Sequencing Storeで開催された最新のKAPA HyperExome V2 プローブについて紹介するウェビナー動画です。

ウェビナー: KAPA HyperExome V2 Probes

講演：イタリア・ヴェローナ大学教授 マッシモ・デレドーネ博士（Massimo Delledonne Ph.D.）May 24, 2023

ウェビナー動画のポイント！
マッシモ・デレドーネ博士は、次世代シーケンスのエキスパートとして知られています。
このウェビナーでは、WES（全エクソームシーケンス）アプリケーションにおける技術の向上について、マッシモ・デレドーネ博士がその概略を解説しています。
特に、新しいKAPA HyperExome V2 プローブを実際に使用した評価データを示し、データカバレッジの向上についてご紹介していますので、ぜひご視聴ください。
ウェビナー動画についてのお問い合わせはこちら

オーダー情報

製品価格

※価格は2023年9月現在のものです。
KAPA HyperExome V2 kitの詳細・価格はこちら

この記事でご紹介した製品

より詳しい資料・取扱説明書などは下記リンクより製品詳細ページをご覧ください。

• KAPA HyperExome V2 kit（デザイン済みヒト全エクソームV 2エンリッチメントキット）