多様なニーズに応えるダイアジェノード社のNGS受託サービス！

この度、日本ジェネティクスのNGS受託解析サービスにダイアジェノード社の「エピジェネティクス受託解析サービス」が新たなラインナップとして加わりました。
Diagenode社はベルギーに本拠地を置き、グローバルに事業展開している、研究ツールと分子診断薬のメーカーです。特にエピジェネティクス研究ツールは高く評価されており、受託解析サービスにおいては、お客様の多様なニーズにお応えしています。
本受託解析サービスについて、お気軽に弊社までお問い合わせください。

ダイアジェノード エピジェネティクス受託解析サービスについて

株式会社ダイアジェノードについて

Diagenode社は、ベルギーに本拠地を置きグローバルに事業展開している、研究ツールと分子診断薬のメーカーです。特にエピジェネティクス研究ツールの開発力が高く、世界中で多くの研究者がDiagenode社の製品を使用して、多くの論文が発表されています。エピジェネティクスは、医療への応用が期待されており、研究者人口が増えてきておりますが、同時に高い品質と性能を有する研究ツールが求められています。Diagenode 社では、世界中のエピジェネティクス研究者からのフィードバックと多くの学術プロジェクトへの参加を通じて習得した最新の知見と技術を用いて製品を開発しており、Diagenode社のエピジェネティクス研究ツールは高い評価を得ております。

ー同社ホームページより引用ー

受託解析サービスの特長

解析の流れ

1. お問い合わせ・お見積り
2. 注文書送付
3. サンプル送付
4. 解析作業
5. 納品物送付

お問い合わせから納品までのおおまかな流れについては下図をご覧ください。

※クリックで拡大

ChIP-seq受託解析サービス

サービス概要

特定のタンパク質または修飾された形態のタンパク質とゲノムDNA 領域間の相互作用を研究する貴重な方法
ゲノム全体でヒストン修飾と転写因子結合をプロファイリングします。
疾患または薬物治療に対する遺伝子発現の調節を理解することができます。

ChIP-seq受託解析の特長

• ENCODE標準を使用したクロマチンの解析
• ウェットラボサービスと完全なChIp-seq解析
• プロジェクトデザインはお客様毎にカスタマイズ
• 様々なエピゲノムデータを統合して解析 　
• プレゼンテーション品質の図表を提供
• エキスパートによるバイオインフォマティクス解析を提供

ChIP-seq受託解析の流れ

Step 1: クロマチン断片化
Step 2: クロマチン免疫沈降（ChIP）
Step 3: ライブラリー調製・シーケンシング

ChIP-seq受託解析サービス価格

※価格はご依頼内容によって変わります。お問い合わせください。
※ChIP-seq受託解析サービスの詳細はこちら

ATAC-seq受託解析サービス

サービス概要

ある状態における細胞内のオープンクロマチン領域をトランスポゼースを用いてゲノムワイドに網羅的にタグ化し、得られたタグ付き断片を含むライブラリーの配列を決定する解析方法
細胞の運命の変化、さまざまな治療条件における特定の疾患の発症に関与する転写因子の研究にご利用いただけます。
プロモーター・エンハンサー・インシュレーターが結合するオープンクロマチン領域を選択的に検出し、遺伝子転写調節機構の解析方法として広く注目を浴びています。

ATAC-seq受託解析の特長

• ダイアジェノード製Tagmentaseは、E. coliから独自技術を用いて精製。
  E. coli DNAのコンタミネーションが一切なく洗練された解析結果を提供可能
• 少数の細胞からオープンクロマチン部位の解析が可能
• 抗体を使用しない手法
• ChIp-seqと比較して低コスト

ATAC-seq受託解析の流れ

Step 1：核の単離とtagmentation
Step 2: ライブラリー調製
Step 3: シーケンシング (Illumina社プラットフォーム使用)

ATAC-seq受託解析サービス価格

※価格はご依頼内容によって変わります。お問い合わせください。
※ATAC-seq受託解析サービスの詳細はこちら

RNA-seq受託解析サービス

サービス概要

次世代シーケンスを用いた生体内の転写産物の種類の特定や定量を通じて、トランスクリプトームの網羅的なプロファイリングを可能とする技術

Total RNA-seq（lncRNAを含む全トランスクリプトーム解析）

全トランスクリプトームを探索することで潜在的な転写調節のメカニズムについての洞察が得られる手法
トランスクリプトーム全体の配列を決定し、特定の状況下で生物学的サンプルに存在するmRNAやlong non-coding RNAを含む完全なRNAのセットを記録することができます。

mRNA-seq

特定の環境下で生物学的サンプルに存在するコーディングRNAを効率的に検出し、正確に定量するために選択される方法
転写物の存在量を正確に推定することで、発現変動解析が可能になります。
　

RNA-seq受託解析の特長

Total RNA-seq（lncRNAを含む全トランスクリプトーム解析）

• rRNAの除去を実施後、コーディング／ノンコーディングRNAの検出
• クロマチンリモデリング／転写・転写後調節に関わるnon-coding RNAの検出
• 多様なサンプル量に対応
• 新規転写産物や新規スプライシングイベントの検出
• FFPEサンプルに対応
  　

mRNA-seq

• Library complexityを重視し、転写産物を高いカバレッジで検出
• 遺伝子発現レベルの正確な比較が可能
• 多様なサンプル量に対応

RNA-seq受託解析の流れ

Step 1: RNA品質チェック
Step 2: ライブラリー調製
Step 3: シーケンシング（Illumina社プラットフォーム使用）
＊大まかな流れはTotal RNA-seq/mRNA-seq共通ですが、ステップ内の項目は異なります。

RNA-seq受託解析サービス価格

※価格はご依頼内容によって変わります。お問い合わせください。
※RNA-seq受託解析サービスの詳細はこちら

DNAメチル化RRBS受託解析サービス

サービス概要

あらゆる脊椎動物のゲノムスケールDNAメチル化解析を1塩基単位の解像度で実施できる手法
バイサルファイト法の利点を有しながら、決定する塩基配列量を圧縮することで費用対効果の高いデータ取得が可能です。
ゲノムを制限酵素MspI (ターゲット部位CCGG）消化することにより、プロモーターやCpGアイランドを含むCpG-rich部位が濃縮され重要なメチル化イベントを解析できます（ヒト由来サンプルで最大700万CpGのカバレッジが得られます）。

DNAメチル化RRBS受託解析の特長

• CpGリッチ領域（5-mC）のメチル化状態を一塩基分解能で解析
• サンプル当たり低価格でご提供
• エピジェネティックバイオマーカー探索に最適
• ゲノム全体のCpGリッチ領域のメチル化パターンを取得可能
• ヒトで最大700万箇所のCpGサイトをカバー
• わずか100 ngのゲノムDNAから解析可能
• UMI (Unique Molecular Identifier) technologyを用いPCR duplicateを除去するため、正確な解析が可能

DNAメチル化RRBS受託解析の流れ

Step 1: ゲノムDNA 品質管理
Step 2: ライブラリー調製
Step 3: シーケンシング(Illumina社プラットフォーム使用)

DNAメチル化RRBS受託解析サービス価格

※価格はご依頼内容によって変わります。お問い合わせください。
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DNAメチル化WGBS受託解析サービス

サービス概要

ゲノム全体のほぼすべてのCpG部位のメチル化パターンを評価し、包括的なDNAメチル化プロファイリングを得るために選択される方法
同じ場所の変換されていないシトシンと変換されたシトシンの割合を比較することで、メチル化レベルを正確に決定することができます。
ゲノムワイドメチル化シーケンス（WGBSおよびEM-seq）は、遺伝子制御に関する深い洞察をもたらし、新規エピジェネティックマーカーや疾患の標的を特定することができます。
全ゲノム上のDNAメチル化部位の状態を一塩基単位の解像度で網羅的に解析する手法であるWGBS受託解析サービス＋酵素的メチル変換法を用いたEM-seqの受託を提供しています。

DNAメチル化WGBS受託解析の特長

WGBS

• バイサルファイト法を用いた塩基変換
• メチル化密度の低い部位やリピート部位で高い5-mCカバレッジを示す
• WGBSはEM-seqと比べFFPE由来サンプルで良い結果が得ることが可能
• バイサルファイト処理、ライブラリー調製、シーケンシング、解析を包括的にサポート
• 1塩基の解像度でゲノムワイドのDNAメチル化解析を実現

EM-seq

• 酵素を用いた塩基変換
• 元のフラグメント長を保ったまま解析（低フラグメンテーション・低分解）
• EM-seqはPCR増幅ステップのサイクル数を低減できるため、WGBSと比べて重複率を低く抑えることが可能
• 酵素的塩基変換、ライブラリー調製、シーケンシング、解析を包括的にサポート
• 1塩基の解像度でゲノムワイドのDNAメチル化解析を実現

DNAメチル化WGBS受託解析の流れ

Step 1: ゲノムDNA 品質管理
Step 2: ライブラリー調製
Step 3: シーケンシング(Illumina社プラットフォーム使用)

DNAメチル化WGBS受託解析サービス価格

※価格はご依頼内容によって変わります。お問い合わせください。
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Targeted DNAメチレーション受託解析サービス

サービス概要

全ゲノム上の既知・特定範囲のメチル化DNAの定量解析手法
Targeted DNA methylationによるメチル化解析は、解析したい範囲に応じいくつかの方法で行うことが可能です。

Targeted DNAメチレーション受託解析の特長

• 透明性：お客様とのコミュニケーションを基にカスタマイズされたプロジェクト設計を実施
• 専門性：専任のデータサイエンティストがプロジェクトの成功をお手伝い
• アウトプット：包括的なデータ分析結果を出版品質の図表にまとめてご提供

Targeted DNAメチレーション受託解析の流れ

Bisulfite Amplicon Sequencing (BSAS)
Step 1: バイサルファイト処理を行ったゲノムDNA上のターゲット領域をPCRで増幅
Step 2: ライブラリー調製
Step 3: シーケンシング（Illumina社プラットフォーム使用）

カスタムキャプチャープローブ
Step 1: 断片化したゲノムDNA上のターゲット領域をRNAプローブで配列選択的にキャプチャー
Step 2: 単離した配列を対象にバイサルファイト処理
Step 3: シーケンシング（Illumina社プラットフォーム使用）

Targeted DNAメチレーション受託解析サービス価格

※価格はご依頼内容によって変わります。お問い合わせください。
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Infinium メチレーションEPICアレイ受託解析サービス

サービス概要

バイサルファイト法を利用したゲノムワイドなDNAメチル化状態を解析できるIllumina社のソリューションで、ゲノム上のヒトCpG部位のメチル化状態を1塩基の分解能で定量することが可能。ヒト・マウスサンプルともに対応可の受託解析サービス
網羅的なヒトゲノム上メチル化DNAの手軽な解析方法です。

Infinium メチレーションEPICアレイ受託解析の特長

• 短納期かつ安価なソリューション
• CpG、非CpG、およびCHHサイトのメチル化領域の定量分析
• Differentially methylated site 解析
• エンドツーエンドのバイサルファイト処理、アレイハイブリダイゼーション、および解析
• 追加FFPE回収ステップにより、FFPEからのサンプルにも対応可能

Infinium メチレーションEPICアレイ受託解析の流れ

Step:エンドツーエンドMethylationEPIC array工程

Infinium メチレーションEPICアレイ受託解析サービス価格

※価格はご依頼内容によって変わります。お問い合わせください。
※Infinium メチレーションEPICアレイ受託解析サービスの詳細はこちら

Humanメチローム受託解析サービス

サービス概要

NGSを用いてヒトの組織検体や血しょう中セルフリーDNAなどリキッドバイオプシーから得られた微量サンプルの網羅的なDNAメチル化プロファイルを取得。
バイオマーカー探索やがん・神経変性・循環器・代謝性疾患のモニタリングに最適

Humanメチローム受託解析の特長

• Human Methylomeパネルを用いることにより、メチル化バイオマーカーの同定を実現
• 398万箇所以上のCpGサイトを解析可能
• 123 Mbのパネルが、ヒトのCpGアイランドサイトの84％以上をカバー
• WGBSより高い費用対効果
• 高いカバレッジでデータ取得
• Twist Bioscienceの技術を活用

Humanメチローム受託解析の流れ

Step 1:
・ゲノムDNAの品質チェックとgDNAのせん断
・断片化処理
Step 2:
・酵素的塩基変換
・ライブラリー構築と特異配列のキャプチャー
Step 3:
・シーケンシング(Illumina社プラットフォーム使用)
・ペアエンド150 bp、サンプル当たり平均60 Mi raw reads – 理論カバレッジ >150 x

Humanメチローム受託解析サービス価格

※価格はご依頼内容によって変わります。お問い合わせください。
※Humanメチローム受託解析サービスの詳細はこちら

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