サンプルQC~データ納品まで全部まとめて1サンプル36,800円!
サンプルQCからデータ納品(ダウンロード)までを、全部まとめてパッケージ化したRNA-Seqデータパッケージキャンペーンを行います。トータルRNAを送るだけで、全部まとめて1サンプル36,800円の大変お得なキャンペーンとなりますので、ぜひご利用ください。
*キャンペーン期間:2024年10月1日~2025年3月31日受注分まで
RNA-Seqデータパッケージキャンペーンについて
RNAサンプルをお送りいただければ、サンプルQC→ストランデッドRNAライブラリー調製→シーケンス→発現データ解析→データ納品までが全てパッケージになったお得なセットです。
サービス内容
- ライブラリー調製:illumina TruSeq Stranded mRNA Library Prep Kit
- シーケンシング :illumina NovaSeq X Plus
- リード形式 :150 PE
- データ量 :6 Gb(4,000万リード)/サンプル
- データ納品 :データダウンロード方式
データ解析メニュー
Mapping + Expression profile + DEG(比較10パターンまで)
※生物種の指定はありません。
- ヒトリファレンス/GRCh38(NCBI_109.20200522)
- マウスリファレンス/mm10(NCBI_108)
- ラットリファレンス/RN6
※ヒト、マウス、ラット以外の生物種の場合、NCBI登録情報などリファレンス情報をご提示ください。
キャンペーン価格
Cat.No. | サービス名 | 価格 (税抜) |
---|---|---|
MG-PROM1 | RNA-Seq+データ解析 お任せパッケージ | ¥36,800/サンプル |
※キャンペーン期間:2025年3月31日まで
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納品レポート
データ納品でお渡しするレポートを一部抜粋してご紹介いたします。
各サンプルの相関関係の把握
各サンプルの相関関係を複数の図表で表しています。
例1
Correlation Matrix for All Samples
サンプルデータごとにピアソンの積率相関係数をとり、ヒートマップ化しています。
例2
Hierarchical Clustering Analysis
サンプルデータごとのノーマライズ値を元に、発現の類似性を階層的に表しています。
例3
Multidimensional Scaling Analysis
二次元プロットにより、発現量のばらつきとサンプルとの相関を表しています。
発現変動遺伝子の分布状況の確認
|FC| ≧ 2 かつp値 < 0.05の遺伝子に対して各種Plotを作図しています。
例4
Volcano Plot between TEST vs CTRL
縦軸をp値の対数、横軸をFC値の対数として分布図化することで、|FC| ≧ 2 かつp値 < 0.05の遺伝子の(青色(-)、黄色(+))の分布を表しています。
※n ≧ 2の際に作成されます。
例5
MA Plot between TEST vs CTRL
縦軸を FC 値の対数、横軸を発現量の相乗平均として分布図化することで、|FC| ≧ 2 かつp値 < 0.05の遺伝子の(青色(-)、黄色(+))の分布を表しています。
※解析結果によっては|FC| ≧ 2 が条件でない場合もございます。
Heatmap Analysis
例6
Heatmap
|FC| ≧ 2 かつp値 < 0.05の遺伝子に対してあわせてノーマライズしたすべてのサンプル及び各比較パターンごとにHeatmapを作成しています。
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