【受託キャンペーン】RNA-Seqデータパッケージキャンペーン

RNA-Seqデータパッケージキャンペーン(2024年10月~2025年3月) 1サンプル36,800円

サンプルQC~データ納品まで全部まとめて1サンプル36,800円!

サンプルQCからデータ納品(ダウンロード)までを、全部まとめてパッケージ化したRNA-Seqデータパッケージキャンペーンを行います。トータルRNAを送るだけで、全部まとめて1サンプル36,800円の大変お得なキャンペーンとなりますので、ぜひご利用ください。

*キャンペーン期間:2024年10月1日~2025年3月31日受注分まで

RNA-Seqデータパッケージキャンペーンについて

RNAサンプルをお送りいただければ、サンプルQC→ストランデッドRNAライブラリー調製→シーケンス→発現データ解析→データ納品までが全てパッケージになったお得なセットです。

サービス概要

5つの工程をパッケージ化し
1サンプル36,800円でご提供いたします。

  1. サンプルQC
  2. ライブラリー調製
  3. RNAシーケンス
  4. データ解析
  5. データ納品(ダウンロード)
llumina NovaSeq XPlus

サービス内容

  • ライブラリー調製:illumina TruSeq Stranded mRNA Library Prep Kit
  • シーケンシング :illumina NovaSeq X Plus
  • リード形式   :150 PE
  • データ量    :6 Gb(4,000万リード)/サンプル
  • データ納品   :データダウンロード方式

データ解析メニュー

Mapping + Expression profile + DEG(比較10パターンまで)
※生物種の指定はありません。

  • ヒトリファレンス/GRCh38(NCBI_109.20200522)
  • マウスリファレンス/mm10(NCBI_108)
  • ラットリファレンス/RN6

※ヒト、マウス、ラット以外の生物種の場合、NCBI登録情報などリファレンス情報をご提示ください。

キャンペーン価格

Cat.No. サービス名 価格
(税抜)
MG-PROM1 RNA-Seq+データ解析 お任せパッケージ ¥36,800/サンプル

※キャンペーン期間:2025年3月31日まで

お見積り・お問い合わせはこちらから

RNA-Seqデータパッケージキャンペーン

納品レポート

データ納品でお渡しするレポートを一部抜粋してご紹介いたします。

各サンプルの相関関係の把握

各サンプルの相関関係を複数の図表で表しています。

例1

Correlation Matrix for All Samples
サンプルデータごとにピアソンの積率相関係数をとり、ヒートマップ化しています。

Correlation Matrix for All Samples

 

例2

Hierarchical Clustering Analysis
サンプルデータごとのノーマライズ値を元に、発現の類似性を階層的に表しています。

RNA-Seq_Hierarchical Clusterin

 

例3

Multidimensional Scaling Analysis
二次元プロットにより、発現量のばらつきとサンプルとの相関を表しています。
RNA-Seq_Multidimensional Scaling Analysis

 

発現変動遺伝子の分布状況の確認

|FC| ≧ 2 かつp値 < 0.05の遺伝子に対して各種Plotを作図しています。

例4

Volcano Plot between TEST vs CTRL
縦軸をp値の対数、横軸をFC値の対数として分布図化することで、|FC| ≧ 2 かつp値 < 0.05の遺伝子の(青色(-)、黄色(+))の分布を表しています。
※n ≧ 2の際に作成されます。

RNA-Seq_Volcano Plot between TEST vs CTRL

 

例5

MA Plot between TEST vs CTRL
縦軸を FC 値の対数、横軸を発現量の相乗平均として分布図化することで、|FC| ≧ 2 かつp値 < 0.05の遺伝子の(青色(-)、黄色(+))の分布を表しています。
※解析結果によっては|FC| ≧ 2 が条件でない場合もございます。

RNA-Seq_MA Polt between TEST vs CTRL

 

Heatmap Analysis

例6

Heatmap
|FC| ≧ 2 かつp値 < 0.05の遺伝子に対してあわせてノーマライズしたすべてのサンプル及び各比較パターンごとにHeatmapを作成しています。

RNA-Seq_Heatmap Analysis

 

 

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