ゲノム解析室では、「一日でも早く良質な結果を」をモットーに、研究者が行う研究者のための次世代シーケンサー受託解析を行っています。
主な解析内容としては、RNA-Seq解析、シングルセル解析、WGS解析、WES解析、HLA解析、菌叢解析など多岐にわたります。
大阪大学のみならず、他の大学や企業様など様々な研究者の方にご利用いただいております。
次世代シーケンサーは、MiSeq、NovaSeq X Plus、DNBSEQ-G400RS、DNBSEQ-T1+、DNBSEQ-G99RS、PromethIONなどを運用し、研究者のニーズに合わせた最適な解析条件のご提案と遺伝子解析支援を行っております。

そうですね。実験デザインから解析、データ提供、論文化支援まで含めたトータルサポートを行っている点が強みとなります。

検体数を増やして処理能力を上げたかったため、384ウェルプレート対応の装置が必要になったことが最初のきっかけでした。また、以前から使用していた旧装置の「LightCycler® 480」（以下、LC 480）が古くなってきたこともあり、日本ジェネティクスの営業担当者の方から当時新製品だったLC PROをご紹介いただきました。

以前から研究室で使用していた旧装置（LC 480）が十分に機能していて、ラボメンバーが使い勝手をよく分かっていた後継の新モデルであったことが決め手になりましたね。また、ホワイトプレートを使用するため、ブロックの清掃をする必要がない点も気に入っています。

旧装置と比べて、まず操作性が大きく向上したと感じています。ユーザーインターフェース（以下、UI） が格段に良くなり、タッチパネルで直感的に扱える点はとても便利ですね。装置としての安定性も高く、操作中にストレスを感じない点も助かっています。
データ処理については、やや手順が多いと感じるところもありますが、こちらの使用用途に合わせて営業担当者の方にパッケージ化していただけたので、実際の作業負担はかなり軽減されました。

旧装置と違ってハロゲンランプが不要になり、より気軽にランを回せるようになった点は大きなメリットですね。夜間の O/N ランがしやすくなったのも嬉しいポイントです。細菌定量のプログラム作成時にも迅速にサポートしていただき、使い方の幅が以前より広がったと感じています。また、定量工程の一律ロボット化を進めていたため、旧装置と同じ消耗品をそのまま使えた点も非常に助かりました。

装置の立ち上がりが早く、電源を入れてすぐにランを開始できる点は日々の作業効率につながっていますね。アプリ内の操作も分かりやすいため、テンプレートを準備しておけばラン開始までとても素早く対応できます。加えて、384ウェルプレートに対応しているので、多くのサンプルを一度に定量できる点も大変重宝しています。

NGS用ライブラリの定量や、細菌定量で使用することが多いですね。私たちの研究室にある2種類のqPCR装置は48/96サンプルにしか対応していないため、384サンプルができるというだけで大きなメリットがあります。個人的には他機種よりもUIが使いやすくて良いと思います。使用頻度は案件内容によって異なりますが、週2～3回稼働させることが多いです。

タッチパネルの画面が大きくて見やすく、使い心地も非常に良く、直感的に操作できる点が気に入っています。総合的に見ても、UI、操作性、処理効率のどれも満足度が高いシステムだと感じています。

同じような実験をルーチンで行っている研究室には向いているのではないでしょうか。
ただ、384ウェルプレートに分注するには、人力による処理は少し厳しいように思います。当研究室では、ロボット2機種を駆使して384ウェル化に対応しています。

何か困ったときなど、トラブルにも迅速にご対応いただけているため安心して使えることができています。