日本ジェネティクスのテクニカルノートとは?
発売したばかりの新製品の性能評価や、既存製品の最適な条件を追求するための条件検討をすることでお客様に心からご納得頂いた上で商品をお使い頂けるよう、様々な評価試験を行っています。
採用前の検討資料として、または採用後の最適条件検討資料としてご活用ください。
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テクニカルノート2018<07> 評価製品:FastGene™ Q-Stain(NE-FG-QS1) |
目的
操作・染色時間と染色像について、既存の染色試薬と比較することで、本製品の有用性を確認する。
評価方法
タンパクラダーマーカーの2倍の希釈系列を作成してそれぞれ電気泳動を行った。
市販の2種類のCBB染色試薬に対し、染色、脱色、操作時間を比較することで、操作の簡便性を評価した。
また、泳動の結果から、既存の製品と感度、染色像の比較を行い、本製品の性能を評価した。
タンパク染色試薬 |
→ 検証結果は結果① 推奨条件での比較 → 検証結果は結果② 染色時間による染色度合 の推移 |
|
ポリアクリルアミドゲル FastGene™ PAGE Gel – 4-20%(CatNo. NE-PGS420) 【特徴】 • 最大 60 μL/well のまでローディング可能 • 幅広いミニ電気泳動チャンバーに適合するポピュラーなミニフォーマットのプレキャストゲル • FastGene MOPS またはMES バッファーに適合 *Tris-Glysin Buffer は使用できません • 泳動条件目安 140 V, 45~55 min |
製品名 | 固定 | 染色 | 脱色 | 安全性 |
Q-Stain(FastGene™) | 不要 | 10~60 min | 不要 (必要に応じて脱色) |
〇 |
自家染色試薬CBB(W社) | 10~60 min | 30~60 min以上 | 適宜 (120~180 min 程度) |
酢酸・メタノール |
市販染色試薬CBB Kit(B 社) | 不要 | 30~60 min | 適宜 (120~180 min 程度) |
酢酸・メタノール |
※各操作時間は、製品のプロトコルまたは、標準的な手順として記載しています。
染色手順の比較
脱色ステップが不要なため、通常の染色時間と比べて、約1/3の時間で作業を終えることができる。
実験
タンパク分子量マーカーの希釈系列を作成した。
■ 希釈溶液:Laemmli サンプルバッファー(BioRad)#1610737
■ タンパク分子量マーカー:プレシジョン Plus プロテイン™ 未着色スタンダード(BioRad)#1610363
① | ② | ③ | ④ | ⑤ | ⑥ | ⑦ | ⑧ | ||
希釈倍率 | 1/1 | 1/2 | 1/4 | 1/58 | 1/16 | 1/32 | 1/64 | 1/128 | |
バンドAのタンパク量 | 750.0 ng | 375.0 ng | 187.5 ng | 93.8 ng | 46.9 ng | 23.5 ng | 11.7 ng | 5.9 ng | |
バンドBのタンパク量 | 150.0 ng | 75.0 ng | 37.5 ng | 18.8 ng | 9.4 ng | 4.7 ng | 2.3 ng | 1.2 ng |
サンプルをそれぞれ、下記の通りアプライを行った。
結果
既存のCBB染色と比較すると、コントラストは従来のCBB染色の方がはっきりしていたが、検出限界量においては同等であった。
以上の結果から、Q-Stainは脱色操作を行わなくとも、CBBと同等の結果を得られることが確認できた。
染色時間10 min ~ 30 minにおいて徐々に検出限界量の改善がみられた。ただし、この試験条件では30 min以上染色しても、検出限界量は上がらなかった。
まとめ
製品名 | 検出限界量 | メリット | デメリット |
Q-Stain (FastGene™) |
46.9 ng |
・バックグラウンドが低いため、脱色を行う必要 |
・CBB 染色と比較して全体的にバンドが薄く みえる。 |
既存染色試薬CBB (W社) |
46.9 ng |
・濃淡がしっかりとしているのでタンパク量が |
・随時調製ではないが、あらかじめ試薬を 準備する必要がある。 ・前固定の工程が必要。 ・脱色液を随時交換が必要。 ・廃液処理(劇物) |
既存染色試薬CBB Kit (B 社) |
46.9 ng | ・濃淡がしっかりとしているのでタンパク量が 確認しやすい。 ・試薬が調製されている。 ・前固定の工程がない。 |
・脱色液を随時調製が必要。 ・染色にムラが出やすい。 ・廃液処理(劇物) |
タンパクの検出確認を短い時間で簡単に行う方法としてFastGene™ Q-Stainは有用と考えられる。
Q-Stain にて60 min 染色を行った。
脱イオン水で20 min の脱色をすると感度が上がるか検証した。