日本ジェネティクスのアプリケーションノートとは?
- 当社製品を実際にご使用頂いた、正真正銘、日本国内の研究者様による評価データ
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メーカー名:KAPA BIOSYSTEMS 社
下記のデータは、日本学術振興会特別研究員PD 大阪大谷大学薬学部免疫学講座 池渕 良洋 様のご厚意により掲載させていただきました。
方法
少数T細胞群の遺伝子配列を調べるため、T細胞溶解液からcDNAを合成し、PCRにより遺伝子の増幅を行った。
● サンプルの条件
Template | |
No1 | T細胞400個分のcDNA溶液 |
No2 | T細胞100個分のcDNA溶液 |
No3 | T細胞 25個分のcDNA溶液 |
No4 | Negative Control (T細胞なし) |
T 細胞溶解液:0.2%TritonX-100
● PCR reaction mixture
<KAPA> (µL)
2×KAPA HiFi HotStart ReadyMix 7.5
Primer A 0.6
Primer B 0.6
DDW 2.3
Template 4
Total 15μL
● PCR condition
<KAPA>
98℃ 3 min
98℃ 20 sec ×5
72℃ 45 sec
98℃ 20 sec
70℃ 15 sec ×5
72℃ 45 sec
98℃ 20 sec
68℃ 15 sec ×25
72℃ 45 sec
72℃ 5 min
4℃ ∞
<TO社製品> (µL)
×10 PCR Buffer 1.5
2mM dNTPs 1.5
25mM MgSO4 0.9
Primer A 0.6
Primer B 0.6
ポリメラーゼ 0.3
DDW 5.6
Template 4
Total 15μL
<TO社製品>
94℃ 2 min
98℃ 10 sec ×5
72℃ 45 sec
98℃ 10 sec ×5
70℃ 45 sec
98℃ 10 sec ×25
68℃ 45 sec
68℃ 7 min
4℃ ∞
<TA社製品> (µL)
×10 PCR Buffer 1.5
×50 dNTP 0.3
Primer A 0.6
Primer B 0.6
ポリメラーゼ 0.3
DDW 7.7
Template 4
Total 15μL
<TA社製品>
95℃ 30 sec
95℃ 5 sec ×5
72℃ 120 sec
95℃ 5 sec
70℃ 10 sec ×5
72℃ 120 sec
95℃ 5 sec
68℃ 10 sec ×25
72℃ 120 sec
4℃ ∞
結果
KAPA 社はT 細胞25 個由来cDNA を含む全てのサンプルから増幅できた。
TO 社製品では全く増幅せず、また、TA 社製品では400 個由来cDNA のみ増幅した。
Template | |
No1 | T細胞400個分のcDNA溶液 |
No2 | T細胞100個分のcDNA溶液 |
No3 | T細胞 25個分のcDNA溶液 |
No4 | Negative Control (T細胞なし) |
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サンプルを頂いた甲斐があります、今後は本製品を使っていこうと思います。