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本日は、Roche社から届いたアプリケーションノートをご紹介します。
新着アプリケーションノート
「KAPA HyperPrepによるPCRフリー・ヒト全ゲノムシークエンスのための柔軟で高効率のライブラリー調製ソリューション」
概要
イルミナのHiSeq XおよびNovaSeq 6000シーケンサーは、シーケンステクノロジーの改善により、１ベースあたりのコストを大幅に削減します。これにより、新しいバイオマーカーと薬物標的の発見、そしてヒトの疾患、健康状態、寿命の理解を深めるために、ポピュレーションベーススタディのヒト全ゲノムシーケンス（WGS）への世界的な投資が促進されました。
現在、次世代シーケンシング（NGS）への幅広いアクセスとルーチンのアプリケーションにおいては、サンプルの準備とデータ分析/レポートの進化が続いています。サンプル前処理に関わるプロバイダーは、自動化を容易にし、所要時間を短縮し、再現性を改善するために、ライブラリー構築方法の合理化に注力しています。さらに、インプットDNAからアダプター付加ライブラリーフラグメントへのより高い変換を達成するために、様々なケミストリーが最適化されています。
これにより、低品質のインプット・サンプルから、PCRフリーのプロトコルでより高い成功率を実現できるようになりました。
KAPA HyperPrep キットは、非常に効率的でオートメーション対応のシングル・チューブライブラリ-構築プロトコルを提供します。広範なケミストリーとプロトコルの最適化により、より高い変換率が可能となり、さまざまなシーケンスアプリケーションで正常に処理できるサンプルの幅が広がります。 柔軟なプロトコルを微調整して、特定のサンプルタイプまたはコホートでパフォーマンスを最適化できます。KAPAデュアルインデックスアダプター、KAPAピュアビーズ、KAPA HiFiライブラリー増幅キット、KAPAライブラリー定量キットなどの一連のアクセサリーと補完製品により、サンプル前処理のワークフローが完成します。
このアプリケーションノートでは、ヒトWGS向けの完全なサンプル前処理ソリューションの優位性をご提示します。これには、より高いライブラリー構築効率、ハイスループットパイプラインをサポートする柔軟性の向上、1社のサプライヤーによるサービスとサポートによる利便性が含まれます。重要な実験的な考察が議論され、高品質なPCRフリー・ヒトWGSライブラリーの調製のための2つの方法が解説されています。HiSeq XとNovaSeq 6000の両方の装置によるHapMapサンプル（NA12878、500 ng入力）から作成されたライブラリーの総合的なデータが示されています。
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